El proyecto BLUE ECOSYSTEM probará metodologías innovadoras enfocadas en apoyar los procesos de toma de decisiones territoriales a través de la producción de conocimiento en el ámbito de la economía azul sostenible, basándose en resultados existentes.​

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El proyecto considera las necesidades de los actores de la quíntuple hélice para mejorar las capacidades de innovación e investigación mediante un enfoque transformador y territorial de co-creación con la creación de laboratorios aceleradores regionales (los denominados laboratorios TRAIN) en las Islas Baleares, Emilia-Romaña, Región Sur-Occitania, el Condado de Zadar, Alentejo, Ática y Albania.

Un proceso de emparejamiento posterior a nivel mediterráneo identificará desafíos y oportunidades transnacionales para la aceleración de soluciones.